In Rats of Wistar schlüpfst du in die Rolle einer der vier Ratten, die die Flucht aus einem Labor organisiert haben. Als solcher musst du deine Familie führen, um zu beweisen, dass du es am meisten verdienst, die gesamte Kolonie zu führen. Dank deiner außergewöhnlichen Fähigkeiten kannst du den Bauernhof erkunden, bis du die Speisekammer erreichst, um den appetitlichen Käse zu ergattern. Durch die Ausbeutung der Artefakte, die von den Menschen am Rande des Waldes zurückgelassen wurden, erschaffst du neue Erfindungen und erweiterst deine Höhle unter den Bäumen, grabst neue Räume und baust neue Betten. Du triffst einheimische Ratten und Mäuse, die du in deiner Familie willkommen heißt, und wenn nötig, besuchst du die Alchemistenmaus, um einen zusätzlichen Vorteil zu erlangen.